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Programmes maison

CHEMIX développe ses propres outils scientifiques pour structurer l’analyse, rendre les méthodes plus lisibles et partager des flux de travail réutilisables.

Programme maison n° 01 · Projet Galalithe

Casein FTIR

Un logiciel maison CHEMIX pour passer d’un spectre infrarouge brut à une lecture structurée, traçable et partageable.

Version 0.2.1PythonLicence MIT
Spectres ATR-FTIR comparés dans le projet Galalithe
Des signaux expérimentaux à une analyse documentée.
À quoi sert-il ?

Rendre l’analyse FTIR plus lisible.

Casein FTIR rassemble dans un même outil les étapes courantes d’une analyse de spectres infrarouges. Il est conçu pour explorer des données, comparer des échantillons et produire des sorties faciles à relire.

01

Importer et prétraiter

Lire des spectres, corriger leur ligne de base, lisser le signal et le normaliser avant comparaison.

02

Détecter les bandes

Repérer les maxima, intégrer des aires et calculer des ratios entre régions spectrales choisies.

03

Explorer l’amide I

Décomposer cette région par ajustement gaussien afin d’examiner plusieurs contributions qui se recouvrent.

04

Comparer

Superposer plusieurs spectres et confronter un échantillon à une référence expérimentale ou théorique.

05

Convertir

Transformer des sorties de calcul Gaussian en données spectrales exploitables dans le même flux de travail.

06

Rendre compte

Générer des rapports texte ou HTML, des tableaux de résultats et un graphique de décomposition.

Déconvolution · Amide I

Voir les contributions qui se recouvrent.

Dans cette démonstration, les points noirs représentent le signal observé, les tirets son ajustement global et les courbes colorées les six composantes gaussiennes proposées par le modèle. Le panneau inférieur montre le résidu, c’est-à-dire l’écart restant entre le signal et l’ajustement.

Déconvolution gaussienne de la bande amide I : signal synthétique observé, ajustement total, six composantes et résidu
Démonstration synthétique. Figure générée par Casein FTIR à partir de l’exemple fourni avec le logiciel. Les pourcentages sont des fractions d’aire attribuées par le modèle ; ils ne constituent pas des populations structurales validées ni un résultat expérimental sur la galalithe.
Flux de travail

De la donnée au rapport.

Chaque étape reste identifiable : le logiciel aide à organiser l’analyse, sans transformer automatiquement une ressemblance spectrale en preuve chimique.

ImporterPrétraiterDétecterComparerRapporter
Pour découvrir l’outil

La distribution contient des exemples synthétiques de caséine et de galalithe. Ils servent à apprendre les commandes et à observer le comportement du logiciel ; ils ne remplacent pas des mesures expérimentales.

Référence théorique intégrée

Un fragment moléculaire pour explorer.

Casein FTIR intègre un spectre théorique associé au fragment N,N′-diéthylméthanediamine (C5H14N2). Ce petit modèle moléculaire représente un pont aminal minimal : il permet d’explorer des correspondances possibles, mais ne décrit ni la caséine complète ni tout le matériau galalithe.

Portée de la référenceLes paramètres ci-contre sont ceux associés au fichier fourni. Le calcul n’a pas été reproduit indépendamment pour cette distribution. Cette référence n’est donc pas un étalon certifié de la galalithe, et une coïncidence de bandes ne suffit pas à démontrer une structure.

Fiche technique du fichier théorique fourni
FragmentN,N′-diéthylméthanediamine, C5H14N2
Niveau de théorieB3LYP/6-311+G(2d,p)
SolvatationIEFPCM dans l’eau
Modes57
Facteur d’échelle0,9679
Ouvert et réutilisable

Un outil CHEMIX, accessible à l’extérieur.

Le code source, le guide et la version 0.2.1 sont publics. Le logiciel est attribué à CHEMIX et distribué sous licence MIT. Les utilisateurs peuvent examiner le code, tester les exemples et adapter le flux de travail à leurs propres données.